Il y a beaucoup d'industries où les filtres du cleanroom HEPA jouent un rôle important en assurant la pureté d'air et en éliminant la contamination potentielle. Des cleanrooms industriels sont employés dans le médical, pharmaceutique, nourriture et boisson, et industries de semi-conducteur, notamment, pour protéger les produits sensibles et les processus contre des infections aéroportées, les particules microscopiques, et d'autres polluants.

Dans les hôpitaux, des filtres du cleanroom HEPA sont utilisés pour créer les salles d'opération stériles et sûres. Dans des industries pharmaceutiques et des produits alimentaires et des boissons, ces filtres sont utilisés pour maintenir un environnement pur qui est exempt de la contamination microbienne et chimique. Dans l'industrie de semi-conducteur, ces filtres aident à réduire la poussière et d'autres particules pour éliminer n'importe quel potentiel pour la contamination sur la chaîne de production.